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http://ri2.bib.udo.edu.ve:8080/jspui/handle/123456789/4147
Title: | PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS AMONG SPECIES OF PROTOTHACA FROM PANAMABASED ON CYTOCHROME C OXIDASE I (COI) SEQUENCES |
Authors: | Ramos, Carlos Castro Pérez, Edgardo Ramadugu, Chandrika Gómez, Juan Villalaz, Janzel Aviléz, Miguel |
Keywords: | genetic difference diferencia genética mtADN mtDNA COI P. asperrima Veneridae |
Issue Date: | 2012 |
Publisher: | Universidad de Oriente |
Citation: | Boletín del IOV (ISSN 0798-0639), Vol 51, No 1, 2012, pags. 75-84 |
Series/Report no.: | Boletín del Instituto Oceanográfico de Venezuela (IOV);Vol 50, No 2 (2011) |
Abstract: | ABSTRACT: The genus Protothaca (Bivalvia: Veneridae) represents a commercially important group of clams with a wide distribution in the Pacific coast of America and Asia. According to The Integrated Taxonomic Information System (ITIS),there are nine accepted species (http://www.itis.gov/); nevertheless the number of recognized species varies based on thesources revised. In this study, a molecular approach was used to phylogenetically analyze five species belonging to the genusProtothaca. A fragment of 550 bp from the mitochondrial cytochrome oxidase I gene was analyzed from P. asperrima, P.columbiensis, P. grata, P. mcgyntyi and P. jedoensis. The COI sequences revealed seven haplotypes for P. asperrima, four for P. columbiensis and two for P. grata. Bayesian analysis showed two major well supported clusters consisting of (1) genus-Protothaca clade and (2) a clade with rest of the members of Veneridae. All the species of Protothaca clustered together withthe exception of P. jedoensis. Intraspecific genetic differences in P. asperrima were very high at 17-18 %; P. columbiensisand P. grata specimens had differences in the range of 0,18-0.36 % and 0,92 % respectively. Interestingly, Protothacaasperrima haplotypes A and H showed the highest level of intraspecific genetic distances. Considering the traditional controversies in classification, the level of COI divergence in P. asperrima haplotypes and the differences observed in othergenera within the family Veneridae, we propose a revision of the species including elevating the rank of the two distinct clusters of P. asperrima to closely related species status. RESUMEN: El género Protothaca (Bivalvia:Veneridae) representa un grupo de almejas comercialmente importantes con una amplia distribución en las costas del Pacífico de América y Asia. De acuerdo con el Sistema Integrado de Información Taxonomica (ITIS), hay nueve especies aceptadas; sin embargo el número de especies reconocidas varía en función de las fuentes revisadas. La taxonomía actual del género se basa en la morfología de la concha y la clasificación sigue siendo controvertida. En este estudio, se utilizó un enfoque molecular para analizar filogenéticamente cinco especies pertenecientes al género Protothaca. Se analizó un fragmento de 550 pb del gen mitocondrial de citocromo oxidasa I de P. asperrima, P.columbiensis, P. grata, P. mcgyntyi y P. jedoensis. Las secuencias de COI revelaron siete haplotipos de P. asperrima, cuatro para P. columbiensis y dos para P. grata. El análisis bayesiano mostró dos grupos principales, bien soportados consistentes en(1) clado del género-Protothaca y (2) un clado con el resto de los miembros de Veneridae. Todas las especies de Protothacaagruparon juntas con la excepción de P. jedoensis. La diferencia genética intraespecífica en P. asperrima fué bastante alta entre 17-18%; Las diferencias entre especímenes de P. columbiensis y P. grata estuvieron en el rango de 0.18-0.36% y 0.92%respectivamente. Curiosamente, los haplotipos A y H de Protothaca asperrima mostraron el nivel más alto de distancias genéticas intraespecífica. Teniendo en cuenta las controversias tradicionales en la clasificación, el nivel de divergencia COI enlos haplotipos de P. asperrima y las diferencias observadas en otros géneros dentro de la familia Veneridae, proponemos una revisión de las especies, incluyendo la elevación del rango de los dos grupos diferentes de P. asperrima al estatus de especies estrechamente relacionadas. |
URI: | http://ri2.bib.udo.edu.ve:8080/jspui/handle/123456789/4147 |
ISSN: | 0798-0639 |
Appears in Collections: | Boletín del IOV - Vol. 51, Nros. 1 y 2 del Año 2012 |
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