Caracterización molecular de aislados del Virus de la Hepatitis b (vhb) en muestras de pacientes provenientes de dos poblaciones Colombianas

Abstract

El virus de la hepatitis B (VHB) tiene una amplia distribución geográfica. Alrededor de dos millardos de personas en el mundo han sido infectados con este virus y cerca 350- 400 millones de éstos son portadores crónicos. Basado en una divergencia mínima del 8% entre las secuencias del genoma completo, el VHB ha sido clasificado en ocho genotipos definidos con las letras desde la A hasta la H. El genotipo F es autóctono de Suramérica y altamente predominante en la región. Adicionalmente este genotipo ha sido subclasificado en cuatro subgenotipos identificados como F1, F2, F3 y F4, los cuales guardan relación con un área geográfica determinada. El subgenotipo F3 frecuentemente se encuentra en el Norte de Suramérica y se relaciona filogenéticamente con la única secuencia de genoma completo del VHB colombiana reportada hasta el momento. En el presente estudio se caracterizaron molecularmente secuencias del VHB provenientes de dos poblaciones colombianas y se compararon filogenéticamente las secuencias del gen s y de genomas completos con secuencias prototipos de aislados de diferentes genotipos del VHB. Para ello se analizaron 126 muestras de sueros positivos para el antígeno de superficie (AgsHB), mediante la técnica de PCR en dos rondas, utilizando iniciadores específicos para las regiones del AgsHB e iniciadores específicos para la amplificación de genomas completos en muestras selectas. Los productos amplificados fueron secuenciados y analizados filogenéticamente. Un total de 47 (37%) amplificaron al menos para una región del AgsHB y solo en uno se amplificó el genoma completo. El análisis filogenético reveló que 41 aislados pertenecen al genotipo F, cuatro al genotipo D, uno al genotipo A y uno al genotipo C. La subgenotipificación de 23 secuencias, logró la asignación eficiente de los subgenotipos, resultando así 17 F3, 3 D2, 1 D3, 1 A2 y 1 C2. Todas las secuencias genotipo F (subgenotipo F3) se encuentran estrechamente relacionada con la única secuencia del VHB colombiana reportada en la base de datos Entrez Nucleotides (www.ncbi.nlm.gov/entrez), lo que se corresponde con la distribución geográfica reportada para el genotipo F y el subgenotipo F3. La presencia de los genotipos A, C y D en la población estudiada podría estar asociada a las diferentes olas migratorias que se han venido dando hacia esta parte del continente. Es evidente observar una alta predominancia del genotipo F sobre otros genotipos (A, C y D) en la población colombiana estudiada, lo cual concuerda con el fuerte acervo genético amerindio que mantiene la población.